三代測(cè)序綜合服務(wù)

服務(wù)介紹  Service Introduction

            第三代測(cè)序技術(shù)（TGS）又稱單分子測(cè)序，通過光學(xué)、納米等技術(shù)直接解析單個(gè)DNA分子的堿基信號(hào)差異，實(shí)現(xiàn)序列讀取。主流平臺(tái)包括Pacific Biosciences的SMRT（熒光信號(hào)測(cè)序）和Oxford Nanopore的納米孔測(cè)序（電流信號(hào)測(cè)序），其核心優(yōu)勢(shì)在于無需擴(kuò)增的單分子直接測(cè)序。該技術(shù)憑借超長(zhǎng)讀長(zhǎng)（可達(dá)數(shù)萬堿基），廣泛應(yīng)用于復(fù)雜基因組組裝、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組分析及微生物群體研究等領(lǐng)域，可突破重復(fù)序列和雜合區(qū)域的組裝瓶頸。在臨床檢測(cè)中，其高精度結(jié)構(gòu)變異檢測(cè)能力（如缺失、倒位）、對(duì)短串聯(lián)重復(fù)（STR）和甲基化特征的識(shí)別優(yōu)勢(shì)，使其在腫瘤基因組學(xué)和罕見病診斷中具有顯著價(jià)值。

服務(wù)優(yōu)勢(shì)  Service Advantages

        單分子測(cè)序：無需PCR擴(kuò)增，直接對(duì)單條DNA/RNA分子測(cè)序，避免擴(kuò)增偏差，保留原始?jí)A基修飾信息）。

        超長(zhǎng)讀長(zhǎng)：單次測(cè)序可達(dá)數(shù)千至數(shù)萬堿基，顯著提升復(fù)雜基因組拼接效率，解決重復(fù)序列和雜合區(qū)域組裝難題。

        高精度與實(shí)時(shí)性：測(cè)序精度高達(dá)99.9999%，部分技術(shù)可實(shí)時(shí)輸出數(shù)據(jù)（如納米孔測(cè)序），滿足動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)需求。

        多應(yīng)用場(chǎng)景覆蓋：適用于全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組分析、結(jié)構(gòu)變異檢測(cè)（如缺失、倒位）、微生物快速鑒定及表觀遺傳研究。

        直接測(cè)序能力：可直接讀取RNA序列，無需反轉(zhuǎn)錄，減少中間環(huán)節(jié)誤差，提升實(shí)驗(yàn)效率與準(zhǔn)確性。

訂購(gòu)信息 

測(cè)序合格樣品要求 

         測(cè)序合格樣品要求

         一、菌液及平板

        1.1體積≥200uL的新鮮菌液；也可提供≥5ml菌液或沉淀菌體直接提取質(zhì)粒。送樣前請(qǐng)做好樣品封存，防止漏液。

        1.2培養(yǎng)好的平板或劃線平板

        *特殊菌液標(biāo)注培養(yǎng)條件；古菌需自行培養(yǎng)后送樣；噬菌體樣本不接收，感謝理解。

        二、質(zhì)粒及PCR產(chǎn)物

        2.1樣品濃度：電泳有明顯條帶，且濃度（Qubit定量）≥10 ng/uL;

        2.2樣品純度（Nanodrop檢測(cè)）: OD260/280在1.8-2.0，OD260/230在2.0-2.2;溶液中不含去污劑、表面活性劑、變性劑，螯合劑和高濃度的鹽，蛋白質(zhì)

        2.3樣品需求量:體積≥20 uL，總量約200ng，50kb以上大質(zhì)粒需要總量≥500ng;

        2.4樣品溶于超純水中（雙蒸水、Milli-Q等），不要使用TE溶解，會(huì)影響后續(xù)反應(yīng)。

        細(xì)菌完成圖合格樣本要求

        一、樣本類型：

        （1）菌沉淀：細(xì)菌、放線菌（致病菌除外）。致病菌目錄請(qǐng)參考《人間傳染的病原微生物目錄（2023版）》表2。危險(xiǎn)等級(jí)分類為二級(jí)的病原不接受。危險(xiǎn)等級(jí)分類為三級(jí)的病原，請(qǐng)滅活后送檢。

        （2）基因組DNA：細(xì)菌、放線菌中提取的基因組。支原體、衣原體、立克次體、螺旋體咨詢。

        二、樣本要求：

        （1）菌沉淀：液體培養(yǎng)至對(duì)數(shù)期,0D600約0.6-0.8,收集菌體 3-5ml，1.5ml離心管低溫4度離心，棄上清，保留管底菌體，液冷凍。建議同時(shí)送 1-2管重復(fù)。

        （2）基因組DNA：DNA 樣品澄清透明，總量≥ 3μg；DNA 純度OD260/280在1.8-2.0之間，OD260/OD230 在2.0-2.2之間；DNA 濃度≥50 ng/μL；DNA完整無降解，無RNA、蛋白質(zhì)等污染，DNA 片段平均長(zhǎng)度

        菌種鑒定合格樣本要求

        一、純菌：接受平板單克隆、菌液、菌沉淀，真菌菌絲。不接受可能的致病菌。

        二、混合菌：接收未分離培養(yǎng)的污染菌等。將污染菌部分轉(zhuǎn)移至 1.5 mL EP 管中。

        AAV測(cè)序合格樣本要求

        總量至少為1.0×10^12完整病毒拷貝，溶解在200μL PBS中（樣本濃度5.0×10^9 GC/μL）。