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首頁 > 科研服務(wù) > 分子診斷平臺 > 細胞株STR鑒定(人源/小鼠)

        據(jù)統(tǒng)計約30%細胞系被交叉污染或錯誤辨識,因使用了交叉污染或錯誤辨識的細胞而導(dǎo)致研究結(jié)論錯誤、結(jié)果不可重


復(fù)、臨床細胞治療災(zāi)難性后果……這浪費大量時間、精力和金錢。



        因此近年NIH、ATCC、Nature和Science等對此多次發(fā)出呼吁,要求研究者對細胞進行鑒定,如2011年美國國家標


準學(xué)會專門頒布了一份細胞STR鑒定國家標準;2014 年12 月、2015 年2 月Science 雜志分別發(fā)表文章專題闡述細胞交叉


污染和錯誤辨識嚴重性;2015 年4 月Nature通知:Nature 旗下雜志將從5 月開始要求作者鑒定論文中所用細胞系;2015


年6月有報道稱一科學(xué)家由于用錯細胞系,撤銷Nature論文。STR(Short Tandem Repeat,短串聯(lián)重復(fù)序列)基因分型


已被ICLAC、ATCC等權(quán)威機構(gòu)作為金標準應(yīng)用于細胞鑒定,目前越來越多的雜志要求在投稿時提供細胞STR分型數(shù)據(jù)。


 圖片1


        STR基因位點由長度為3~7個堿基對的短串連重復(fù)序列組成,這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中,可作為高度多


態(tài)性標記,被稱為細胞的DNA指紋(如目前我們親子鑒定即采用該技術(shù)),其可通過PCR(聚合酶鏈式反應(yīng))來檢測。



一、何時需做細胞STR鑒定? 


  1、發(fā)表文章或申請課題經(jīng)費前;


  2、使用細胞進行臨床治療(試驗)前;


  3、準備凍存保種或已凍存多年的細胞;


  4、一個涉及到細胞試驗項目開始/結(jié)束時;


  5、新得到的細胞或?qū)嶒炇遗囵B(yǎng)5代以上的細胞;


       6、細胞系表現(xiàn)不穩(wěn)定或結(jié)果與預(yù)期差別較大;



二、已開始要求細胞STR鑒定的期刊 


      · Nature;


      · BioTechniques;


      · Cancer Research;


      · Cancer Discovery;


      · Clinical Cancer Research;


      · Molecular Cancer Research;


      · Cancer Prevention Research;


      · International Journal of Cancer;


      · Molecular Cancer Therapeutics;


      · Cell Biochemistry and Biophysics;


      · Cancer Epidemiology, Biomarkers & Prevention;


      · In Vitro Cellular & Developmental Biology – Animal;


      ·  ......



三、細胞STR鑒定,艾基更專業(yè)


         專業(yè)化團隊:積累了近5年的親子鑒定的資質(zhì)和資歷,擁有細胞生物學(xué)專業(yè)服務(wù)隊伍,專業(yè)解讀細胞STR數(shù)據(jù);


         專業(yè)的結(jié)題報告:出具中/英文結(jié)題報告書(含STR分型圖譜及搜庫鑒定結(jié)果);


         高準確度:符合最新ANSI/ATCC標準,測試結(jié)果99.99%與文獻吻合;


         標準檢測與分析:ABI3130和3730基因分析儀和GeneMapper數(shù)據(jù)處理軟件;


         多基因檢測、高靈敏度:可同時檢測21個STR位點,僅需2ng DNA即可判斷細胞類型及可能的細胞交叉污染;


常用的21個STR位點名稱

圖片2


        高性價比:高競爭力的服務(wù)價格和完善的售后技術(shù)支持服務(wù)。


        快速交付:1~48個樣品僅需3~5個工作日、49~96個樣本僅需4~7個工作日;



四、艾基細胞STR鑒定服務(wù)項目


    · 人源細胞STR分型檢測;


    · 小鼠源細胞STR鑒定檢測;


    · 人/鼠細胞交叉污染檢測;



五、艾基細胞STR鑒定服務(wù)流程



 圖片3

 

 

 

 

六、資料下載


        IGE-細胞STR株鑒定委托書 



七、常見問題解答


1、請問做細胞STR鑒定有何用?


答:細胞STR鑒定主要應(yīng)用于將人源細胞用于研究、生產(chǎn)的客戶,包括但不限于以下領(lǐng)域:醫(yī)學(xué)、遺傳學(xué)、藥物開發(fā)、疫


苗研制、生物技術(shù)和制藥行業(yè)、再生醫(yī)學(xué)、干細胞、腫瘤、免疫細胞治療、病毒檢測和治療及基礎(chǔ)細胞生物學(xué)等,通過細


胞STR鑒定,您可以:


<1>. 判斷您培養(yǎng)的該細胞是否被其他細胞交叉污染及其可能被污染的細胞名稱;


<2>. 明確知道自己正在使用的細胞是否“正確”——2015年有文獻報道稱:國內(nèi)建立的人源細胞系竟有高達85.51%是錯


的!

 

2、若我需要鑒定的細胞沒有文獻報道有STR數(shù)據(jù),請問還能做STR鑒定嗎?


答:盡管我司建立的STR數(shù)據(jù)庫有目前最全的人源細胞系STR數(shù)據(jù),但有些文獻未報道STR數(shù)據(jù)的細胞系(國內(nèi)自行建立的


細胞系)在我們數(shù)據(jù)庫中可能也沒有其STR數(shù)據(jù)。不過,我們?nèi)越ㄗh您進行細胞STR鑒定,因為通過該項檢測,您可以:


<1>. 判斷您培養(yǎng)的該細胞是否被其他細胞交叉污染及其可能被污染的細胞名稱;


<2>. 您將是第一個得到該細胞系STR數(shù)據(jù)(DNA指紋)的人;


<3>. 該細胞系的STR數(shù)據(jù)將保存在我們數(shù)據(jù)庫中,方便您以后調(diào)用、比對。

 

3、我的研究結(jié)果發(fā)不了《Nature》,請問還有必要做細胞STR鑒定嗎?


答:只要您使用細胞從事相關(guān)研究工作,我們強烈建議對您的細胞進行鑒定,原因如下:


<1>. 2015年有文獻報道稱:國內(nèi)建立的人源細胞系竟有高達85.51%是錯的?。?!


<2>. 目前不止《Nature》需要細胞鑒定結(jié)果,很多雜志也陸續(xù)要求投稿者提供細胞鑒定數(shù)據(jù);


<3>. 退一萬步說,即使我們使用細胞的目的不是用來發(fā)表文章,如因為我們使用了“錯誤”的細胞或者被其他細胞污染的


細胞,而導(dǎo)致得出不可靠的實驗結(jié)論,那多年的辛苦豈不白費、可惜?如2014年炒得沸沸揚揚的日本美女科學(xué)家小保方晴


子的STAP細胞鬧劇,后來證實是污染了胚胎干細胞。

 

4、請問該如何送樣測試?


答:為保證樣品質(zhì)量和STR鑒定效果,我們不建議客戶直接送檢自己提取好的基因組DNA。推薦客戶直接寄送細胞沉淀,


方法:用PBS將細胞洗2遍后,收集細胞于一干凈無菌離心管中,離心、去上清,即得細胞沉淀(細胞數(shù)≥106個,細胞沉


淀應(yīng)至少肉眼明顯可見),用封口膜封好離心管管口以防止樣品泄漏及其他細胞污染。樣品隨冰袋寄送到我司即可。

 

5、請問貴司可以進行人干細胞系鑒定嗎?


答:可以。目前我司的細胞系STR數(shù)據(jù)庫包含2000來株人胚胎干細胞、hiPSCs、間充質(zhì)干細胞系STR數(shù)據(jù)。

 

6、請問貴司的項目周期為多長?


答:1~48個樣品,在確認收到樣品及相應(yīng)款項后3~5個工作日內(nèi)完成鑒定;49~96個樣品,在收到樣品及相應(yīng)款項后4~7


個工作日內(nèi)完成鑒定工作。


 

八、參考文獻:


1. Reid, Y.A., Characterization and authentication of cancer cell lines: an overview.Methods Mol Biol, 2011. 731: p. 35-43.


2. Capes-Davis, A., et al., Check your cultures! A list of cross-contaminated or misidentified cell lines.Int J Cancer, 2010. 127(1): p. 1-8.


3. Chatterjee, R., Cell biology. Cases of mistaken identity.Science, 2007. 315(5814): p. 928-31.


4. Lorsch, J.R., F.S. Collins, and J. Lippincott-Schwartz, Cell Biology. Fixing problems with cell lines.Science, 2014. 346(6216): p. 1452-3.


5. Neimark, J., Line of attack.Science, 2015. 347(6225): p. 938-40.


6. Zhao, M., et al., Assembly and initial characterization of a panel of 85 genomically validated cell lines from diverse head and neck tumor sites.Clin Cancer Res, 2011. 17(23): p. 7248-64.


7. Masters, J.R., Cell-line authentication: End the scandal of false cell lines.Nature, 2012. 492(7428): p. 186.


8. McLaren, R.S., Y. Reid, and D.R. Storts, Human cell line authentication: the critical first step in any project using human cell lines.Methods Mol Biol, 2013. 963: p. 341-53.


9. Announcement: Time to tackle cells’ mistaken identity.Nature, 2015. 520(7547): p. 264-264.


10. American Type Culture Collection Standards Development Organization Workgroup, A.S.N., Cell line misidentification: the beginning of the end.Nat Rev Cancer, 2010. 10(6): p. 441-8.


11. Editorial, It is time for all involved to tackle the chronic scandal of cell-line contamination. Funders first.Nature, 2009. 457: p. 2.


12. ANSI/ATCC, Authentication of Human Cell Lines: Standardization of STR Profiling. 2011, ASN-0002-2011.


13. Masters, J.R., et al., Short tandem repeat profiling provides an international reference standard for human cell lines.Proc Natl Acad Sci U S A, 2001. 98(14): p. 8012-7.


14. Edwards, A., et al., DNA typing and genetic mapping with trimeric and tetrameric tandem repeats.Am J Hum Genet,1991. 49(4): p. 746-56.


15. Sorensen, T., A Method of Establishing Groups of Equal Amplitude in Plant Sociology Based on Similarity of Species Content and Its Application to Analyses of the Vegetation on Danish commons.Biol Skr, 1948. 5: p. 1-34.


16. Ye, F., et al., Genetic profiling reveals an alarming rate of cross-contamination among human cell lines used in China.FASEB J, 2015. 29(10): p. 4268-72.

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