微生物菌種鑒定

服務(wù)介紹  Service Introduction

          細(xì)菌的 rRNA 是細(xì)胞內(nèi)含量最多的 RNA，約占 RNA 總量的 80% 以上，由高度保守區(qū)和可變區(qū)組成。

        細(xì)菌的 rRNA 包括 5S、 16S、 23S，其中 5S rRNA 信息量少，不適合分析。23S rRNA 盡管分子大，信息量多，但堿基突變速度較快，同樣不適用于細(xì)菌鑒定。16S rDNA 是編碼原核生物核糖體小亞基 16S rRNA的 DNA 序列，相比之下遺傳較為穩(wěn)定，長(zhǎng)度在 1550±200 bp 左右，信息量適中，可以用于研究系統(tǒng)進(jìn)化。目前已經(jīng)報(bào)道了 10,000 種以上的細(xì)菌 16S rDNA 序列。 16S測(cè)序是細(xì)菌菌種鑒定的金標(biāo)準(zhǔn)。 

技術(shù)流程 Technical Procedures

16s rDNA 示意圖 

樣品要求及注意事項(xiàng) Sample Requirements And Notes 

•    基因組 DNA：OD 260/280 在 1.8-2.0 之間（OD260/230 最好大于 1.5），濃度 ≥ 30 ng/μl, 體積 ≥ 20 μl，且無(wú)明顯降解； 

•    建議提供培養(yǎng)過(guò)的菌液，體積 >2 ml，請(qǐng)確保提供的菌液是經(jīng)過(guò)分離培養(yǎng)的單菌落，因樣本不純?cè)斐傻臏y(cè)序雙峰，將全額收取實(shí)驗(yàn)費(fèi)用；

•    特殊樣品 , 如放線菌、厭氧菌等，請(qǐng)直接提供基因組 DNA，革蘭氏陽(yáng)性菌，建議提供基因組 DNA；

•    不接受有致病性的樣品 , 如果菌體帶有致病性，請(qǐng)?zhí)峁┗蚪M DNA，并進(jìn)行加熱處理以殺死致病菌；

•    由于有些真菌形態(tài)與細(xì)菌相似，難以判斷，在無(wú)法獲得 16S rDNA 結(jié)果時(shí)，建議考慮進(jìn)行真菌 ITS 區(qū)序列分析； 

•    對(duì)于測(cè)序雙峰的樣本，可以提供克隆測(cè)序的服務(wù)。

交付結(jié)果  Results Delivery

•    測(cè)序峰圖及序列文件 

•   16S rDNA 序列拼接文件 

•    序列分析比對(duì)結(jié)果 

增資服務(wù) Additional Service

 對(duì)于測(cè)序雙峰的樣品，可提供克隆測(cè)序服務(wù)，價(jià)格：380 元 / 樣品； 包含：片段克隆，6 個(gè)陽(yáng)性克隆測(cè)序，序列比對(duì)分析。

資料下載

細(xì)菌16SrDNA菌種鑒定服務(wù)委托書